Аннотация
С начала пандемии COVID-19 выросло потребление антибиотиков населением, так как в большинстве случаев контактными лицами первой линии были врачи первичной медико-санитарной помощи, которые в значительной степени полагаются на антибиотики в своей повседневной практике. Наиболее часто используемыми антибиотиками были коамоксиклав, доксициклин, цефалоспорины и особенно макролиды из-за их противовоспалительных свойств. Эмпирическое использование вышеупомянутых антибиотиков в первичной медико-санитарной помощи согласуется с их терапевтическим применением в большинстве больниц и может быть обоснованно в качестве меры предосторожности.
Различают ненаследуемую и наследуемую антибиотикорезистентность. Последняя связана с применением антимикробных средств, являющимися, химическими мутагенами, такими как фторхиналоны. Опасность наследуемой антибиотикорезстентности в том, что мутации имеют стационарную хромосомную локализацию, поэтому способствуют накоплению уровня мультирезистентности и инфекционной компетентности микроорганизмов. «Инфекционная компетентность» определяется как способность микроорганизмов постоянно адаптироваться и развиваться, используя механизмы факторов вирулентности и УПП, что приводит к увеличению выживаемости, инвазии или роста. Присоединение вторичных и коинфекций способствует проявлениям «инфекционной компетентности», а именно склонности к вирулентности и повышенной устойчивости к антибиотикам микробиома кишечника за счет появления факторов вирулентности у индигенной и комменсальной микрофлоры.
Генетическая гибкость и адаптивность E. coli к постоянно меняющимся условиям окружающей среды позволяют приобретать большое количество механизмов устойчивости к противомикробным препаратам. Биоинформационный анализ генов резистентности к АМП общих для нескольких видов микроорганизмов предполагает, что 48 видов порядка Enterobacteriaceae могут быть потенциальными носителями 97 таких генов. Escherichia coli содержит максимальное количество мобильных генетических элементов, 60% которых несут гены резистентности. Таким образом, комменсальные штаммы E. coli рассматриваются как индикаторы микробной нагрузки на своих хозяев.
Таким образом, актуальной задачей является мониторинг множественной лекарственной устойчивости микробиоты кишечника, которая является естественным резервуаром генов множественной лекарственной устойчивости. Появление большого количества штаммов с экстремальной лекарственной устойчивостью и панрезистентных штаммов повышает вероятность формирования ESKAPE-патогенов индигенного происхождения с фенотипом МЛУ, что в случае последующей госпитализации может служить дополнительным риск-фактором развития ИСМП. Использование антибиотикорезистентности комменсальных штаммов E.coli в качестве индикатора антибиотикорезистентности микробиоты кишечника является удобным инструментом мониторинга.
Annotation
Since the beginning of the COVID-19 pandemic, antibiotic consumption by the population has increased, as in most cases the first-line contacts were primary care physicians who rely heavily on antibiotics in their daily practice. The most commonly used antibiotics were co-amoxiclav, doxycycline, cephalosporins and especially macrolides due to their anti-inflammatory properties. The empirical use of the above-mentioned antibiotics in primary care is consistent with their therapeutic use in most hospitals and can be justified as a precautionary measure.
A distinction is made between non-hereditary and hereditary antibiotic resistance. The latter is associated with the use of antimicrobials that are chemical mutagens, such as fluoroquinolones. The danger of hereditary antibiotic resistance is that mutations have a stationary chromosomal localization, therefore they contribute to the accumulation of a level of multi-resistance and infectious competence of microorganisms. «Infectious competence» is defined as the ability of microorganisms to continuously adapt and evolve using virulence and AMR mechanisms, resulting in increased survival, invasion, or growth. The addition of secondary and coinfections contributes to the manifestation of «infectious competence», namely, a tendency toward virulence and increased antibiotic resistance in the gut microbiome due to the emergence of virulence factors in indigenous and commensal microflora.
The genetic flexibility and adaptability of E. coli to constantly changing environmental conditions allow it to acquire a large number of antimicrobial resistance mechanisms. Bioinformatic analysis of AMP resistance genes common to several microbial species suggests that 48 species of the order Enterobacteriaceae may be potential carriers of 97 such genes. Escherichia coli contains the maximum number of mobile genetic elements, 60% of which carry resistance genes. Thus, commensal E. coli strains are considered as indicators of the microbial load on their hosts. Thus, an urgent task is to monitor the multidrug resistance of the intestinal microbiota, which is a natural reservoir of multidrug resistance genes. The emergence of a large number of strains with extreme drug resistance and pan-resistant strains increases the likelihood of the formation of ESKAPE pathogens of indigenous origin with the MDR phenotype, which in the case of subsequent hospitalization can serve as an additional risk factor for the development of HAI. The use of antibiotic resistance of commensal E. coli strains as an indicator of antibiotic resistance of the intestinal microbiota is a convenient monitoring tool.
Keywords: antibiotic resistance, ESKAPE pathogens, COVID-19, epidemiological studies, multidrug resistance.
Список литературы
Л И Т Е РАТ У РА ( п . п . 3 , 6 , 8 – 1 6 , 1 8 – 2 1 , 2 3
– 2 9 , 3 2 , 3 4 – 5 0 , 5 2 – 6 3 , 6 5 – 6 8 , 7 0 – 7 4 ,
7 6 , 7 9 с м . R E F E R E N C E S )
1. Алешкин В.А., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Воропаева Е.А.,
Афанасьев М.С., Алешкин А.В. и др. Микробиоценозы и здоровье
человека. ООО «Издательство «Династия». М.: 2015.
2. Кожевников А.А., Раскина К.В., Мартынова Е.Ю., Тяхт А.В., Пер-
фильев А.В., Драпкина О.М. и др. Кишечная микробиота: совре-
менные представления о видовом составе, функциях и методах
исследования. РМЖ. 2017; 17: 1244-1247.
4. Усенко Д.В. Антибиотик-индуцированные изменения микробиома
желудочно-кишечного тракта и их коррекция. РМЖ. 2018; 2(ll):
96-99.
5. Ярец Ю.И. Патогенный потенциал бактерий группы ESKAPE, вы-
деленных из ран: характеристика фено-и генотипических марке-
ров и возможность их практического применения. Журнал Грод-
ненского государственного медицинского университета. 2022; 20;
4: 400-413. https://doi.org/10.25298/2221-8785-2022-20-4-400-413
7. Митрохин С.Д., Миронов А. Ю., Алёшкин А. В. «Конец эры анти-
биотиков» — миф или реальность: что показала прошедшая пан-
демия COVID-19. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2024;
29(1): 29-39. DOI 10.17816/EID623450
17. Петрова Л.В., Миронов А.Ю., Гусаров В.Г. Видовой спектр ми-
кроорганизмов, выделенных у пациентов госпиталя COVID-19
многопрофильного федерального медицинского учреждения.
Эпидемиология и инфекционные болезни. 2021; 26(6): 270-82. DOI
10.17816/EID109205
22. Никифоров В.В., Суранова Т.Г., Миронов А.Ю. Пандемия корона-
вирусной инфекции COVID-19. Алгоритм действий медицинских
работников поликлиники при выявлении больного с подозрени-
ем на данный коронавирус. Медицинский алфавит. 2020; 2: 6-13.
DOI 10.33667/2078-5631-2020-2-6-13
30. Шевелёва С.А. Антибиотикоустойчивые микроорганизмы в пище
как гигиеническая проблема (обзорная статья). Гигиена и сани-
тария. 2018; 97(4): 342-354. DOI: http://dx.doi.org/10.18821/0016-
9900-2018-97-4-342-354
31. Марцулевич М.В. Соколова Т.Н. Генетические механизмы устой-
чивости бактерий к ципрофлоксацину (Литературный обзор).
Журнал Гродненского государственного медицинского универси-
тета. 2023; 21(6): 531-5
33. Миронов А. Ю., Шепелин И.А. Генетика микробов. – М.: ООО
«Эпидбиомед-диагностика», 2024. ISBN 978-5-6044247-2-8.
51. Потехина Н.Н., Рахманов Р.С., Пискарев Ю.Г., Гришин Д.Б., Орлов
Е.В. Организация эпидемиологического надзора за антибиотико-
резистентностью возбудителей гнойно-септической инфекции в
условиях поликлиники. ЗНиСО. 2014; 11(260).
64. Сужаева Л.В. Егорова С.А. Молекулярные классы Β-лактамаз у
штаммов E. coli, выделенных из микробиоты кишечника. Моле-
кулярная диагностика и биобезопасность — 2023 : сборник тези-
сов Конгресса с международным участием, Москва, 27–28 апреля
2023 года. – Москва: Федеральное бюджетное учреждение науки
«Центральный научно-исследовательский институт эпидемиоло-
гии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав по-
требителей и благополучия человека, 2023. EDN WOIRNU.
69. Смирнова С. С., Михайлова Ю. В., Беломестнов С. Р. Характери-
стика резистома штаммов энтерококков, выделенных у пациенток
перинатального центра. Молекулярная диагностика и биобезопас-
ность — 2023 : сборник тезисов Конгресса с международным уча-
стием, Москва, 27–28 апреля 2023 года. – Москва: Федеральное
бюджетное учреждение науки «Центральный научно-исследова-
тельский институт эпидемиологии» Федеральной службы по над-
зору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека,
2023. EDN EITHYL
75. Сужаева, Л. В., Войтенкова Е. В. Метициллинрезистентный
Staphylococcus aureus в микробиоте кишечника. Материалы II
интернет-конференции по инфекционным болезням «Покровские
чтения»: Сборник тезисов конференции, Москва, 01–03 ноября
2022 года. – Москва: Общество с ограниченной ответственностью
«Медицинское Маркетинговое Агентство», 2022. EDN UPRMYQ.
77. Боровкова Е. А. Использование аутопробиотикотерапии для кор-
рекции микроэкологических нарушений кишечника. Автореф.
дис. канд. биол. наук, 2021; Ставрополь.
78. Анисимова, Е. А. Яруллина Д. Р. Оценка вклада лактобацилл в
распространение генов антибиотикорезистентности среди бак-
терий кишечной микробиоты. Инновационные решения актуаль-
ных вопросов биологической и токсикологической безопасности:
Сборник материалов Всероссийской научно-практической конфе-
ренции с международным участием, Казань, 23–24 ноября 2023
года. Казань, 2023. EDN GPERDM.
R E F E R E NC E S
1. Aleshkin V.A., Afanas’ev S.S., Karaulov A.V., Voropaeva E.A.,
Afanas’ev M.S., Aleshkin A.V. et al. Microbiocenoses and human
health. OOO «Izdatel’stvo «Dinastiya». M.: 2015. 548 s. (in Russian)
2. Kozhevnikov A.A., Raskina K.V., Martynova E.YU., Tyaht A.V.,
Perfil’ev A.V., Drapkina O.M. et al. Intestinal microbiota: modern
ideas about species composition, functions and research methods.
RMZH. 2017;17:1244-1247. (in Russian)
3. Qin J. et al. A human gut microbial gene catalogue established by
metagenomic sequencing. Nature. 2010, 4; 464 (7285): 59-65.
4. Usenko D.V. Antibiotic-induced changes in the gastrointestinal tract
microbiome and their correction. RMZh. 2017; 17: 1244-1247. (in
Russian)
5. Yarets YU. I. Pathogenic potential of ESKAPE group bacteria isolated
from wounds: characteristics of pheno- and genotypic markers and
the possibility of their practical application. Zhurnal Grodnenskogo
gosudarstvennogo meditsinskogo universiteta. 2022; 20; 4: 400-413.
https://doi.org/10.25298/2221-8785-2022-20-4-400-413 (in Russian)
6. Merad M, Blish CA, Sallusto F, Iwasaki A. The immunology and immunopathology
of COVID-19. Science. 2022; 375: 1122–7.
7. Mitrokhin S.D., Mironov A.YU., Aloshkin A.V. “The End of the Antibiotic
Era” — Myth or Reality: What the Past COVID-19 Pandemic
Has Shown. Epidemiologiya i infektsionnyye bolezni. 2024; 29(1): 29-
39. DOI 10.17816/EID623450. (in Russian)
8. WHO Coronavirus (COVID-19) dashboard. https://covid19.who.int/.
Accessed 10 Sept 2022.
9. Fischer A, et al. Long COVID symptomatology after 12 months and
its impact on quality of life according to initial coronavirus disease
2019 disease severity. Open Forum Infect Dis. 2022; 9: ofac397.
10. Wu Y, et al. Prolonged presence of SARS-CoV-2 viral RNA in faecal
samples. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2020; 5: 434–5.
11. Chen Y, et al. Six-month follow-up of gut microbiota richness in patients
with COVID-19. Gut. 2022; 71: 222–5.
12. Yeoh YK, et al. Gut microbiota composition reflects disease severity
and dysfunctional immune responses in patients with COVID-19.
Gut. 2021; 70: 698–706.
13. Kim D, Quinn J, Pinsky B, Shah NH, Brown I. Rates of co-infection
between SARS-CoV-2 and other respiratory pathogens. JAMA. 2020;
323: 2085–6.
14. Lansbury L, Lim B, Baskaran V, Lim WS. Co-infections in people
with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J Infect.
2020; 81: 266–75.
15. Garcia-Vidal C, et al. Incidence of co-infections and superinfections
in hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study.
Clin Microbiol Infect. 2021; 27: 83–8.
16. Rutsaert L, et al. COVID-19-associated invasive pulmonary
aspergillosis. Ann Intensive Care. 2020; 10: 71.
17. Petrova L.V., Mironov A.YU., Gusarov V.G. Species spectrum of microorganisms
isolated from patients of the COVID-19 hospital of a
multidisciplinary federal medical institution. Epidemiologiya i infektsionnyye
bolezni. 2021; 26(6): 270-82 — DOI 10.17816/EID109205.
(in Russian)
18. Buehrle D.J.; Nguyen M.H.; Wagener M.M.; Clancy C.J. Impact of
the Coronavirus Disease 2019 Pandemic on Outpatient Antibiotic
Prescriptions in the United States. Open Forum Infect. Dis. 2020; 7:
ofaa575.
19. Armitage R.; Nellums L.B. Antibiotic prescribing in general practice
during COVID-19. Lancet Infect. Dis. 2021; 21: e144.
20. Alzueta N., Echeverría A., García P., Sanz L., Gil-Setas A., Beristain
X. et al. Impact of COVID-19 Pandemic in Antibiotic Consumption
in Navarre (Spain): An Interrupted Time Series Analysis.
Antibiotics 2023; 12: 318.
21. Zhu, N.; Aylin, P.; Rawson, T.; Gilchrist, M.; Majeed, A.; Holmes,
A. Investigating the impact of COVID-19 on primary care antibiotic
prescribing in North West London across two epidemic waves. Clin.
Microbiol. Infect. 2021; 27: 762–768.
22. Nikiforov V.V., Suranova T. G., Mironov A. YU. Pandemiya koronavirusnoy
infektsii COVID-19. Algorithm of actions of medical workers
of a polyclinic when identifying a patient with suspected coronavirus.
Meditsinskiy alfavit. 2020; 2: 6-13.– DOI 10.33667/2078-5631-2020-
2-6-13 (in Russian)
23. Karampela, I.; Dalamaga, M. Could Respiratory Fluoroquinolones,
Levofloxacin and Moxifloxacin, Prove to be Beneficial as an Adjunct
Treatment in COVID-19? Arch. Med. Res. 2020; 51: 741–742.
24. Rizvi, S.G.; Ahammad, S.Z. COVID-19 and antimicrobial resistance:
A cross-study. Sci. Total Environ. 2022; 807: 150873.
25. Parasher, A. COVID-19: Current understanding of its Pathophysiology,
Clinical presentation and Treatment. Postgrad. Med. J. 2021; 97: 312–320.
26. Nestler M.J., Godbout E., Lee K., Kim, J., Noda A.J., Taylor P. et
al. Impact of COVID-19 on pneumonia-focused antibiotic use at an
academic medical center. Infect. Control Hosp. Epidemiol. 2021; 42:
915–916.
27. Bendala Estrada A.D., Calderón Parra J., Fernández Carracedo
E., Muiño Míguez A., Ramos Martínez A., Muñez Rubio E. et al.
Inadequate use of antibiotics in the COVID-19 era: Effectiveness of
antibiotic therapy. BMC Infect. Dis. 2021; 21: 1144.
28. World Health Organization. COVID-19 Clinical Management: Living
Guidance, 25 January 2021; World Health Organization: Geneva,
Switzerland, 2021.
29. Fattorini L., Creti R., Palma C., Pantosti A. Bacterial coinfections
in COVID-19: An underestimated adversary. Ann. Ist. Super. Sanita.
2020; 56: 359–364.
30. Shevelova S.A. Antibiotic-resistant microorganisms in food as a
hygienic problem (review article). Gigiyena i sanitariya. 2018; 97(4):
342-354. DOI: http://dx.doi.org/10.18821/0016-9900-2018-97-4-
342-354 (in Russian)
31. Martsulevich, M.V. Sokolova T.N. Genetic mechanisms of bacterial
resistance to ciprofloxacin (Literature review) Zhurnal Grodnenskogo
gosudarstvennogo meditsinskogo universiteta. 2023; 21(6): 531-5 (in
Russian)
32. Correia S, Poeta P, Hébraud M, Capelo JL, Igrejas G. Mechanisms of
quinolone action and resistance: where do we stand? J Med Microbiol.
2017; 66(5): 551-559. doi: 10.1099/jmm.0.000475
33. Mironov A. YU., Shepelin I.A. Genetics of microbes. M.: OOO «Epidbiomed-
diagnostika», 2024. ISBN 978-5-6044247-2-8. (in Russian)
34. Rodríguez-Martínez JM, Machuca J, Cano ME, Calvo J, Martínez-
Martínez L, Pascual A. Plasmid-mediated quinolone resistance: Two
decades on. Drug Resist Updat. 2016; 29: 13-29. doi: 10.1016/j.
drup.2016.09.001
35. Shaheen A, Tariq A, Iqbal M, Mirza O, Haque A, Walz T, Rahman
M. Mutational Diversity in the Quinolone Resistance-Determining
Regions of TypeII Topoisomerases of Salmonella Serovars. Antibiotics
(Basel). 2021; 10(12): 1455. doi: 10.3390/antibiotics10121455.
36. Zhang X., McDaniel A.D., Wolf, L.E., Keusch, G.T., Waldor, M.
K., & Acheson, D.W. Quinolone antibiotics induce Shiga toxinencoding
bacteriophages, toxin production, and death in mice. The
Journal of infectious diseases. 2000; 181(2): 664–670. https://doi.
org/10.1086/315239
37. Bearson B.L., & Brunelle B.W. Fluoroquinolone induction of
phage-mediated gene transfer in multidrug-resistant Salmonella.
International journal of antimicrobial agents. 2015; 46(2): 201–204.
https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2015.04.008
38. Sutcliffe SG, Shamash M, Hynes AP, Maurice CF. Common Oral
Medications Lead to Prophage Induction in Bacterial Isolates from
the Human Gut [published correction appears in Viruses. 2022 Dec
21; 15(1):]. Viruses. 2021; 13(3): 455. doi:10.3390/v13030455
39. Chiang, Y. N., Penadés, J. R., & Chen, J. Genetic transduction by
phages and chromosomal islands: The new and noncanonical. PLoS
pathogens. 2019; 15(8): e1007878. https://doi.org/10.1371/journal.
ppat.1007878
40. Takeuchi N., Hamada-Zhu S., & Suzuki H. Prophages and plasmids
can display opposite trends in the types of accessory genes they
carry. Proceedings. Biological sciences. 2023; 290(2001): 20231088.
https://doi.org/10.1098/rspb.2023.1088
41. Chen, J., Quiles-Puchalt, N., Chiang, Y.N., Bacigalupe, R., Fillol-
Salom, A., Chee M.S.J. et al. Genome hypermobility by lateral
transduction. Science (New York, N.Y.). 2018; 362(6411): 207–212.
https://doi.org/10.1126/science.aat5867
42. Borodovich T., Shkoporov A.N., Ross R.P., & Hill C. Phage-mediated
horizontal gene transfer and its implications for the human gut
microbiome. Gastroenterology report. 2022; 10: goac012. https://doi.
org/10.1093/gastro/goac01239
43. Santoso P, et al. ГМР pathogens organisms as risk factor of mortality
in secondary pulmonary bacterial infections among COVID-19
patients: observational studies in two referral hospitals in West Java.
Indonesia Int J Gen Med. 2022; 15: 4741–51.
44. D’Costa VM, et al. Antibiotic resistance is ancient. Nature. 2011; 477:
457–61.
45. Beceiro A, Tomás M, Bou G. Antimicrobial resistance and virulence:
a successful or deleterious association in the bacterial world? Clin
Microbiol Rev. 2013; 26: 185–230.
46. Martínez JL, Baquero F. Interactions among strategies associated
with bacterial infection: pathogenicity, epidemicity, and antibiotic
resistance. Clin Microbiol Rev. 2002; 15: 647–79.
47. Burrus V, Waldor MK. Shaping bacterial genomes with integrative
and conjugative elements. Res Microbiol. 2004; 155: 376–86.
48. Rybak B, et al. Antibiotic resistance, virulence, and phylogenetic
analysis of E. coli strains isolated from free-living birds in human
habitats. PLoS ONE. 2022; 17: e0262236.
49. Masri L, et al. Host-pathogen coevolution: the selective advantage of
Bacillus thuringiensis virulence and its cry toxin genes. PLoS Biol.
2015; 13: e1002169.
50. de Nies L, et al. PathoFact: a pipeline for the prediction of virulence
factors and antimicrobial resistance genes in metagenomic data.
Microbiome. 2021; 9: 49.
51. Potekhina N.N., Rakhmanov R.S., Piskarev YU.G., Grishin D.B.,
Orlov Ye.V. Organization of epidemiological surveillance of
antibiotic resistance of pathogens causing purulent-septic infection in
a polyclinic setting. ZNiSO. 2014; 11(260): 49-51 (in Russian)
52. Steen A.D., Crits-Christoph A., Carini, P., DeAngelis, K.M., Fierer,
N., Lloyd, K.G. et al. High proportions of bacteria and archaea across
most biomes remain uncultured. ISME J. 2019; 13: 3126–3130. doi:
10.1038/s41396-019-0484-y
53. Duarte A.S.R., Stärk K.D.C., Munk, P., Leekitcharoenphon, P.,
Bossers, A., Luiken, R. et al. Addressing learning needs on the use of
metagenomics in antimicrobial resistance surveillance. Front. Public
Heal. 2020; 8:38. doi: 10.3389/fpubh.2020.00038
54. Imchen M, Moopantakath J, Kumavath R, Barh D, Tiwari S, Ghosh
P and Azevedo V. Current Trends in Experimental and Computational
Approaches to Combat Antimicrobial Resistance. Front. Genet. 2020;
11: 563975. doi: 10.3389/fgene.2020.563975
55. de Nies L., Galata V., Martin-Gallausiaux C. et al. Altered infective
competence of the human gut microbiome in COVID-19. Microbiome.
2023; 11: 46. https://doi.org/10.1186/s40168-023-01472-7
56. Stokes H.W., and Gillings, M.R. Gene flow, mobile genetic elements
and the recruitment of antibiotic resistance genes into gram-negative
pathogens. FEMS Microbiol. 2011; 35: 790–819. doi: 10.1111/j.1574-
6976.2011.00273.x
57. Zhang X., Wu B., Zhang Y., Zhang T., Yang L., Fang, H.H. P., et al.
Class 1 integronase gene and tetracycline resistance genes tetA and
tetC in different water environments of Jiangsu Province, China.
Ecotoxicology. 2009; 18: 652–660. doi: 10.1007/s10646-009-0332-3
58. Sheikh B. A., Bhat B.A., Ahmad Z., Mir M.A. Strategies employed to
evade the host immune response and the mechanism of drug resistance
in Mycobacterium tuberculosis: in search of finding new targets. Curr.
Pharm. Biotechnol. 2022; 23(14): 1704-1720. doi: 10.2174/1389201
023666211222164938
59. Hall R.M., Collis C.M. Mobile gene cassettes and integrons: capture and
spread of genes by site-specific recombination. Mol. Microbiol. 1995;
15: 593–600. doi: 10.1111/j.1365-2958.1995.tb02368.x
60. Kang Y, Chen S, Chen Y, Tian L, Wu Q, Zheng M, Li Z. Alterations
of fecal antibiotic resistome in COVID-19 patients after empirical
antibiotic exposure. Int J Hyg Environ Health. 2022; 240: 113882.
doi: 10.1016/j.ijheh.2021.113882
61. Su Q, Liu Q, Zhang L, Xu Z, Liu C, Lu W, et al. Antibiotics and
probiotics impact gut antimicrobial resistance gene reservoir in
COVID-19 patients. Gut Microbes. 2022; 14(1): 2128603. doi:
10.1080/19490976.2022.2128603.
62. Osterblad M., Hakanen A., Manninen R., Leistevuo T., Peltonen R.,
Meurman O. et al. Between-species comparison of antimicrobial resistance
in enterobacteria in fecal flora. Antimicrob. Agents Chemother. 2000;
44(6): 1479–1484. doi: 10.1128/AAC.44.6.1479-1484.2000.
63. Zhu X., Ge Y., Wu T., Zhao K., Chen Y., Wu B. et al. Co-infection with
respiratory pathogens among COVID-2019 cases. Virus Res. 2020;
285: 198005. doi: 10.1016/j.virusres.2020.198005
64. Suzhayeva L.V., Yegorova S.A. Molecular classes of Β-lactamases in
E. coli strains isolated from the intestinal microbiota Molekulyarnaya
diagnostika i biobezopasnost’ — 2023 : sbornik tezisov Kongressa
s mezhdunarodnym uchastiyem, Moskva, 2023 goda. Moskva:
Federal’noye byudzhetnoye uchrezhdeniye nauki «Tsentral’nyy
nauchno-issledovatel’skiy institut epidemiologii» Federal’noy sluzhby
po nadzoru v sfere zashchity prav potrebiteley i blagopoluchiya
cheloveka, 2023. EDN WOIRNU. (in Russian)
65. Liu H, Zhu B, Liang B, Xu X, Qiu S, Jia L, et al. A Novel mcr-1
Variant Carried by an IncI2-Type Plasmid Identified From a Multidrug
Resistant Enterotoxigenic E. coli. Front. Microbiol. 2018; 9: 815. doi:
10.3389/fmicb.2018.00815
66. Szmolka A and Nagy B. Multidrug resistant commensal E. coli in
animals and its impact for public health. Front. Microbiol. 2013; 4:
258. doi: 10.3389/fmicb.2013.00258
67. Zeng L., Zhang J., Li C., Fu Y., Zhao Y., Wang Y. et al. The
determination of gyrA and parC mutations and the prevalence of
plasmid-mediated quinolone resistance genes in carbapenem resistant
klebsiella pneumonia ST11 and ST76 strains isolated from patients in
heilongjiang province, china. Infect. Genet. Evol. 2020; 82: 104319.
doi: 10.1016/j.meegid.2020.104319
68. Bird M.T, Greig D.R, Nair S, Jenkins C, Godbole G and Gharbia
S.E. Use of Nanopore Sequencing to Characterise the Genomic
Architecture of Mobile Genetic Elements Encoding blaCTX-M-15
in E. coli Causing Travellers’ Diarrhoea. Front. Microbiol. 2022; 13:
862234. doi: 10.3389/fmicb.2022.862234
69. Smirnova S.S. Mikhaylova S.S Belomestnov S.R. Characteristics of the
resistome of enterococcal strains isolated from patients of the perinatal
center. Molekulyarnaya diagnostika i biobezopasnost’ — 2023 : sbornik
tezisov Kongressa s mezhdunarodnym uchastiyem, Moskva, 27–28
aprelya 2023 goda. Moskva: Federal’noye byudzhetnoye uchrezhdeniye
nauki «Tsentral’nyy nauchno-issledovatel’skiy institut epidemiologii»
Federal’noy sluzhby po nadzoru v sfere zashchity prav potrebiteley i
blagopoluchiya cheloveka, 2023. EDN EITHYL (in Russian)
70. Sparo M, Delpech G and García Allende N Impact on Public
Health of the Spread of High-Level Resistance to Gentamicin and
Vancomycin in Enterococci. Front. Microbiol. 2018; 9: 3073. doi:
10.3389/fmicb.2018.03073
71. Haug S., Lakew T., Habtemariam G., Alemayehu W., Cevallos V.,
Zhou Z. et al. The decline of pneumococcal resistance after cessation
of mass antibiotic distributions for trachoma. Clin. Infect. Dis. 2010;
51: 571–574.
72. Gaynor B.D., Chidambaram J.D., Cevallos V., Miao Y., Miller K.,
Jha H.C. et al. Topical ocular antibiotics induce bacterial resistance at
extraocular sites. Br. J. Ophthalmol. 2005; 89: 1097–1099.
73. O’Brien K.S., Emerson P., Hooper P.J., Reingold A.L., Dennis
E.G., Keenan J.D. et al. Antimicrobial resistance following mass
azithromycin distribution for trachoma: A systematic review. Lancet
Infect. Dis. 2019; 19: e14–e25.
74. Serisier D.J. Risks of population antimicrobial resistance associated
with chronic macrolide use for inflammatory airway diseases. Lancet
Respir. Med. 2013; 1: 262–274.
75. Suzhayeva L.V. Voytenkova Ye.V. Methicillin-resistant Staphylococcus
aureus in the intestinal microbiota. Materialy II internet-konferentsii
po infektsionnym boleznyam «Pokrovskiye chteniya»: Sbornik tezisov
konferentsii, Moskva, 01–03 noyabrya 2022 goda. – Moskva: Obshchestvo
s ogranichennoy otvetstvennost’yu «Meditsinskoye Marketingovoye
Agentstvo», 2022. EDN UPRMYQ. (in Russian)
76. Hau SJ, Haan JS, Davies PR, Frana T and Nicholson TL. Antimicrobial
Resistance Distribution Differs Among Methicillin Resistant
Staphylococcus aureus Sequence Type (ST) 5 Isolates From Health
Care and Agricultural Sources. Front. Microbiol. 2018; 9:2102. doi:
10.3389/fmicb.2018.02102
77. Borovkova Ye. A. Use of autoprobiotic therapy for correction of
intestinal microecological disorders. Avtoref. dis. kand. biol. nauk,
Stavropol’, 2021. (in Russian)
78. Anisimova Ye.A. Yarullina D.R. Assessment of the contribution
of lactobacilli to the spread of antibiotic resistance genes among
intestinal microbiota bacteria. Innovatsionnyye resheniya aktual’nykh
voprosov biologicheskoy i toksikologicheskoy bezopasnosti: Sbornik
materialov Vserossiyskoy nauchno-prakticheskoy konferentsii s
mezhdunarodnym uchastiyem, Kazan’, 23–24 noyabrya 2023 goda. –
Kazan’, 2023. EDN GPERDM. (in Russian)
79. Rossi F, Amadoro C, Gasperi M, Colavita G. Lactobacilli Infection
Case Reports in the Last Three Years and Safety Implications.
Nutrients. 2022; Mar 11;14(6):1178. doi: 10.3390/nu14061178.
PMID: 35334835; PMCID: PMC8954171